マシジミはヤマトシジミとほぼ同じ大きさであるが、淡水域に生息し、表面の光沢が弱く、黒斑を持つ。 稚貝ではヤマトシジミにみられる表面の放射帯はみられない。 殻頂部の膨らみもヤマトシジミに比べて弱く、内面は濃紫色である。 マシジミは雌雄